實驗目的:對全基因組DNA樣品進行100-500bp區間的片段化處理
實驗設備:非接觸DNA打斷儀XM-M220(單槽)
基因組DNA樣品超聲打斷的實驗步驟:
1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機啟動,設置溫度為4℃。
2.將每個0.2mL EP管加入130μL濃度為12ng/μL的全基因組DNA溶液。
3.將2管裝好樣品的0.2mL EP管分別放入儀器的適配器當中,其他空余的孔位由加同樣體積水的0.2mL EP管補齊。
4.程序設置:溫度4℃,超聲工作時間20s 間隔時間10s,總時長分別為3分鐘和4分鐘。
5.程序結束后,取出樣品使用毛細管電泳進行基因組片段化檢測。
打斷完的毛細管電泳檢測結果圖:
1.程序設置:溫度4℃,超聲工作時間20s 間隔10s,總時長4分鐘
2.平均片段大小:266 bp,99-503 bp區間占比 89.33%。
實驗注意事項:
1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機啟動,設置溫度為4℃
2.試用TPX材質的EP管,管子的材質影響超聲打斷效果。
3.客戶在做實驗時一定要讓跟隨著老師一起做實驗,不然后續結果不理想無法分析出原因。
非接觸超聲波DNA打斷儀采用等溫、旋轉離心管及非接觸的方式對樣品進行打斷勻漿和混合。通過球面固態超聲換能器將聲波以三維方式聚焦到樣本區域,聚焦聲波能夠以不同角度的能量輸入獲得良好的處理效果。